Kök Hücre ve Doku Mühendisliği Uygulama ve Araştırma Merkezi (İSÜKÖK)
Moleküler Kanser Uygulama ve Araştırma Merkezi (İSÜMKAM)
Nörolojik Bilimler Uygulama ve Araştırma Merkezi (ISUCAN)
3B Tasarım ve Prototipleme Uygulama ve Araştırma Merkezi (İSÜ3D)
Kuşak ve Yol Çalışmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi (KUYÇAM)
Sürekli Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi
Türkçe Eğitimi ve Öğretimi Uygulama ve Araştırma Merkezi
Ekonomi ve Politika Uygulama ve Araştırma Merkezi
Güvenlik ve Savunma Stratejileri Uygulama ve Araştırma Merkezi
Yapay Zeka Uygulama ve Araştırma Merkezi